Infection et immunité des poissons
Les recherches visent à la compréhension des mécanismes biologiques générés par des agents infectieux (virus et bactéries) chez la truite arc-en-ciel. Elles se situent aux plans cellulaire, moléculaire et génétique et vont de la description des agents pathogènes à la caractérisation de la réaction de l'hôte, offrant l'accés à de nouveaux moyens de sollicitation des défenses spécifiques et non spécifiques chez les vertébrés.
1- Interactions agent pathogène / hôte et immunité chez les poissons :
- La réponse antivirale non spécifique à différents virus (rhabdobvirus, birnavirus) est étudiée dans deux espèces « modèle » de poissons : la truite arc en ciel, salmonidé d’importance aquacole et le poisson zèbre, espèce modèle en génomique, biologie du développement et immunologie. La réponse innée est étudiée en particulier par des méthodes d'analyse des transcriptomes, et complétée par des approches fonctionnelles qui conjuguent les avantages des deux espèces modèles. Les mécanismes d’action de gènes viro-induits sélectionnés sont analysés in vitro et in vivo, dans le cadre de l’étude de l’inflammation en particulier chez le poisson zèbre. La famille multigénique des proteines « TRIM » ou « RBCC » constitue un centre d’intérêt particulier du groupe.
- Les aspects particuliers des réponses immunitaires spécifiques des poissons sont étudiés chez la truite à travers l’analyse de la structure des répertoires B et T, dans différents tissus et au cours des infections. Des méthodologies basées sur la visualisation des profils de taille de jonctions des TCR et Ig, ou sur du séquençage 454 permettent de suivre les réponses des cellules T alpha beta et des cellules B exprimant différents isotypes.
2- Agents pathogènes et pathogénie :
- Détermination de la séquence du génome de Flavobacterium psychrophilum. Détermination des bases moléculaires de la virulence et de l'antigénicité pour les rhabdovirus des salmonidés (SHV, NHI) et suivie de l'évolution génétique des souches de terrain. Etude par des techniques classiques et moléculaires des bactéries de la famille des Flavobacteriaceae pathogènes pour les poissons. Surveillance de la résistance aux antibiotiques.
3- Bases génétiques de la résistance de la truite arc-en-ciel à différentes infections :
- Participation à la cartographie des gènes impliqués dans la résistance à la SHV et à la flavobactériose, identification des mécanismes responsables de la résistance et de la sensibilité de clones haploides doublés en collaboration avec l'équipe Genaqua de l'unité GABI (INRA, Jouy en Josas).
L’équipe Infection et Immunité des poissons a accès à une plate-forme expérimentale d’infectiologie permettant d’effectuer des infections virales ou bactériennes de la truite arc-en-ciel et du poisson zèbre. Cette plate-forme s’intégre dans l’unité “Installations expérimentales rongeurs-poissons” du campus de l’INRA de Jouy en Josas.
Rédaction :
Armel HOUEL
Date de création : 25 Février 2009
Mise à jour : 27 Janvier 2012
